Rendre votre recherche reproductible, c’est relever le nouveau défi de la science pour améliorer ses résultats
Le Mooc « Recherche reproductible : principes méthodologiques pour une science transparente » propose des principes méthodologiques pour une science ouverte et transparente inscrite désormais dans « le plan national pour la science ouverte ». Le cours aborde de manière pratique des thématiques telles que la prise de notes, le document computationnel, la réplicabilité des analyses.
La troisième session de MOOC, proposé par Inria Learning Lab, est ouverte pour une durée longue (au moins un an) à partir du 20 mars 2020. L‘ensemble des contenus est disponible dès le lancement avec une délivrance d’attestations de suivi tous les 3 mois : vous pouvez ainsi suivre le MOOC à votre rythme et selon vos besoins ! Le temps estimé pour suivre ce cours et faire les exercices est de 24h.
Ce MOOC est pour vous tous, doctorant-e-s, chercheur-se-s, étudiant-e-s en master, enseignant-e-s, ingénieur-e-s de toutes disciplines qui souhaitez vous former à des environnements de publication et des outils modernes et fiables. Arnaud Legrand, Chercheur en informatique (CNRS/LIG, Inria, UGA), Christophe Pouzat, Neurophysiologiste (CNRS/MAP5 Univ. Paris Descartes), Konrad Hinsen, Biophysicien (CNRS, Centre de biophysique moléculaire, Soleil) poseront les bases d’une recherche reproductible et vous expliqueront comment utiliser les bons outils :
- Markdown pour la prise de note structurée
- des outils d’indexation (DocFetcher et ExifTool)
- GitLab pour le suivi de version et le travail collaboratif
- Notebooks (Jupyter, Rstudio ou Org-mode) pour combiner efficacement calcul, représentation et analyse des données
Détail du cours
Nous proposons dans ce MOOC trois parcours différents utilisant chacun une technologie de Notebook :
- Le premier parcours repose sur Jupyter et le langage Python (ou R). Il ne nécessite aucune installation de votre part sur votre ordinateur.
- Le deuxième parcours repose sur RStudio et le langage R.
- Le troisième parcours repose sur Emacs/Org-Mode et les langages Python et R.
Nous vous présenterons également les enjeux et les difficultés de la recherche reproductible. À l’issue de ce MOOC, vous aurez acquis les techniques vous permettant de préparer des documents réplicables et de partager en toute transparence les résultats de vos travaux.
Nouveautés 3e session
De nombreux contenus ont été ajoutés dans cette nouvelle session :
- des vidéos sur git/Gitlab pour les débutants,
- un aperçu historique de la recherche reproductible,
- des synthèses et des témoignages pour des besoins spécifiques aux domaines des sciences humaines et sociales.
Pour voir la description du cours et s’inscrire dès à présent, rendez-vous sur la plateforme FUN.
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